استخراج dna از گونه های ماکرو جلبکی حاوی میزان بالای ترکیبات پلی ساکاریدی و فنولی جهت مطالعات ژنتیکی

Authors

کیانا پیریان

خسرو پیری

سعید تمدنی جهرمی

جلوه سهرابی پور

امیر اقبال خواجه رحیمی

abstract

استخراج dna خالص و کافی از ماکرو جلبک ها به علت دارا بودن رنج وسیعی از متابولیت­های ثانویه، نحوه اشتباه نمونه­برداری و خصوصیات مرفولوژی کی آن ها، معمولاً مشکل است. ازآنجاکه استخراج dna خالص جهت مطالعات مولکولی از اهمیت ویژه­ای برخوردار است این ­مطالعه باهدف استخراج آسان و ارزان dna ژنومی باکیفیت و کمیت بالا از نمونه­های ماکرو جلبکی انجام شد. استخراج dna توسط روش­های فنول-کلروفرم، ctab و ctab تغییریافته انجام شد و همچنین نیتروژن مایع جهت خرد کردن نمونه­ها حذف گردید. درروش ctab تغییریافته، تغییراتی در نسبت حجم بافر استخراج به نمونه، ترکیبات بافر استخراج (افزایش غلظت edta، بتامرکاپتواتانول و افزودن pvp و سارکوسیل) ایجاد شد. واکنش pcr بر اساس ژن tufa جهت اطمینان از خلوص dna انجام شد. در ارزیابی کمی و کیفی dna استخراجی، نسبت 280/260 نانومتر بین 84/1-7/1 و نسبت 230/260 نانومتر بیشتر از 2 نشان داده شده و همچنین غلظت dna بین 8-5/6 میکروگرم بر میکرو لیتر اندازه­گیری شد. محصولات pcr باندهایی را در محدوده 700-800 جفت باز در ژل آگارز نشان دادند. ارزیابی کمی و کیفی داده­ها، خلوص و میزان بالای dna استخراج شده به روش ctab تغییریافته نسبت به دو روش دیگر را نشان دادند، به طوری که نسبت­ها نشان­دهنده عاری بودن dna از ترکیبات پروتئینی و پلی­فنولی/ پلی­ساکاریدی است. ازآنجاکه آلودگی­های پلی­ساکاریدی و فنولی بازدارنده آنزیم­های واکنش pcr هستند بنابراین نتایج موفقیت آمیز واکنش pcr نشان­دهنده خلوص dna استخراج شده و کاربرد آن در مطالعات مولکولی است.dna استخراج شده به روش بهینه شده در این مطالعه مناسب جهت مطالعات مولکولی و نگهداری است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

استخراج DNA از گونه های ماکرو جلبکی حاوی میزان بالای ترکیبات پلی ساکاریدی و فنولی جهت مطالعات ژنتیکی

استخراج DNA خالص و کافی از ماکرو جلبک‌ها به علت دارا بودن رنج وسیعی از متابولیت­های ثانویه، نحوه اشتباه نمونه­برداری و خصوصیات مرفولوژی کی آن‌ها، معمولاً مشکل است. ازآنجاکه استخراج DNA خالص جهت مطالعات مولکولی از اهمیت ویژه­ای برخوردار است این ­مطالعه باهدف استخراج آسان و ارزان DNA ژنومی باکیفیت و کمیت بالا از نمونه­های ماکرو جلبکی انجام شد. استخراج DNA توسط روش­های فنول-کلروفرم، CTAB و CTAB تغی...

full text

معرفی یک روش جهت استخراج DNA از اکتینومایست های هوازی

سابقه و هدف: استخراج DNA از اکتینومیست های هوازی به دلیل پیچیدگی ساختمان دیواره سلولی آنها با روش های روتین برای استخراج DNA متفاوت است. در این مطالعه از روش جوشاندن به همراه محلول STET buffer برای استخراجDNA از این باکتری ها استفاده گردید. مواد و روش ها: با استفاده از محلول STET buffer ، ژنوم میکروارگانیسم ها استخراج گردید. کیفیت و کمیت DNA استخراج شده، با استفاده از اسپکتروفوتومتر و الکتر...

full text

مقایسه روش‌های مختلف استخراج RNA کل از سه گونه آویشن غنی از ترکیبات فنولی و متابولیت‌های ثانویه

گیاهان دارویی منبع غنی از مواد مؤثره برای تولید فراورده­های دارویی هستند. جنس آویشن (Thymus) متعلق به خانواده نعناعیان است که بیش از 18 گونه آن در نواحی مختلف ایران پراکنش دارند. اثرات دارویی این گیاه مربوط به ترکیبات مختلف ازجمله مونوترپن­های فنولی کارواکرول و تیمول است، اما این ترکیبات فنولی و متابولیت­های ثانویه دیگر به­عنوان مشکل اصلی استخراج RNA مناسب برای تجزیه و تحلیل بیان ژن و مهندسی ژن...

full text

مقایسه روش های مختلف استخراج rna کل از سه گونه آویشن غنی از ترکیبات فنولی و متابولیت های ثانویه

گیاهان دارویی منبع غنی از مواد مؤثره برای تولید فراورده­های دارویی هستند. جنس آویشن (thymus) متعلق به خانواده نعناعیان است که بیش از 18 گونه آن در نواحی مختلف ایران پراکنش دارند. اثرات دارویی این گیاه مربوط به ترکیبات مختلف ازجمله مونوترپن­های فنولی کارواکرول و تیمول است، اما این ترکیبات فنولی و متابولیت­های ثانویه دیگر به­عنوان مشکل اصلی استخراج rna مناسب برای تجزیه و تحلیل بیان ژن و مهندسی ژن...

full text

تاثیر شرایط عصاره‌گیری به کمک فراصوت بر میزان استخراج ترکیبات فنولی و فلاونوئیدی از میوه سنجد زینتی (Elaeagnus umbellate)

مقدمه: گیاهان منبع غنی از ترکیبات فنلی (اسیدهای فنلی، فلاونوئیدها و تانن­ها) هستند که مهم­ترین آنتی­اکسیدان­های طبیعی به شمار می­آیند. هدف از تحقیق حاضر بررسی تاثیر دو شیوه استخراج با فراصوت اعم از پروب و حمام، بر میزان استخراج ترکیب­های فنولی، فلاونوئیدی و قدرت مهار رادیکال­های آزاد DPPH از میوه سنجد زینتیبا استفاده از سه حلال استخراجی آب، متانول80% و اتانول70% بود. مواد و روش­ها: در دو روش ح...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
زیست شناسی دریا

جلد ۷، شماره ۴، صفحات ۶۷-۷۸

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023